As part of the development of AutoCloner, primers for ~ 80,000 high-confidence genes from the IWGSC RefSeq v1.0 assembly have been generated using the pipeline. These primers can be used to clone genes in other wheat varieties and discover new sequence variation.


Gene name:


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1A 2A 3A 4A 5A 6A 7A
1B 2B 3B 4B 5B 6B 7B
1D 2D 3D 4D 5D 6D 7D


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Gene name Chromosome Position
TraesCS5D01G014800 5D 8492922
TraesCS5D01G014900 5D 8495702
TraesCS5D01G015200 5D 8641463
TraesCS5D01G015300 5D 8641493
TraesCS5D01G015400 5D 8937059
TraesCS5D01G015500 5D 8954898
TraesCS5D01G015600 5D 9012655
TraesCS5D01G015700 5D 9068493
TraesCS5D01G015800 5D 9109448
TraesCS5D01G015900 5D 9119402
TraesCS5D01G016000 5D 9122081
TraesCS5D01G016200 5D 9290817
TraesCS5D01G016300 5D 9331318
TraesCS5D01G016600 5D 9471005
TraesCS5D01G016700 5D 9493495
TraesCS5D01G016800 5D 9526298
TraesCS5D01G016900 5D 9548029
TraesCS5D01G017000 5D 9575231
TraesCS5D01G017200 5D 9728374
TraesCS5D01G017300 5D 9900922
TraesCS5D01G017400 5D 9948738
TraesCS5D01G017500 5D 10042382
TraesCS5D01G017700 5D 10467837
TraesCS5D01G017800 5D 10470753
TraesCS5D01G017900 5D 10494907
TraesCS5D01G018100 5D 10536473
TraesCS5D01G018400 5D 10769048
TraesCS5D01G018500 5D 10773429
TraesCS5D01G018600 5D 10897299
TraesCS5D01G018700 5D 11008513
TraesCS5D01G018800 5D 11301638
TraesCS5D01G018900 5D 11306982
TraesCS5D01G019000 5D 11364861
TraesCS5D01G019100 5D 11431830
TraesCS5D01G019400 5D 11949643
TraesCS5D01G019600 5D 12222519
TraesCS5D01G019700 5D 12591895
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TraesCS5D01G019900 5D 12602757
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TraesCS5D01G020100 5D 12923592
TraesCS5D01G020200 5D 12936174
TraesCS5D01G020500 5D 13171604
TraesCS5D01G020600 5D 13313989
TraesCS5D01G020700 5D 13325208
TraesCS5D01G020800 5D 13715569
TraesCS5D01G020900 5D 13718958
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TraesCS5D01G022100 5D 14969528
TraesCS5D01G022200 5D 14974525
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TraesCS5D01G023900 5D 19746648
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TraesCS5D01G024100 5D 20958435
TraesCS5D01G024200 5D 21012514
TraesCS5D01G024300 5D 21216369
TraesCS5D01G024600 5D 21462271
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TraesCS5D01G024900 5D 22051801
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TraesCS5D01G025300 5D 22441237
TraesCS5D01G025500 5D 22859354
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TraesCS5D01G026200 5D 23842791
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TraesCS5D01G027100 5D 24880573
TraesCS5D01G027200 5D 24968822
TraesCS5D01G027300 5D 24973951
TraesCS5D01G027400 5D 24975718
TraesCS5D01G027500 5D 25042309


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